В 2019 году исполняется 25 лет со дня основания Владикавказского научного центра. Указом Президента РСО-А Ахсарбека Хаджимурзаевича Галазова № 269 от 27 декабря 1994 г. был организован Государственный научный центр Республики Северная Осетия-Алания для проведения единой научно-технической политики и решения задач социально-экономического развития республики. В 2000 году Центр вошёл в состав Российской академии наук как региональный научный центр РАН, созданный совместно Президиумом РАН и Правительством РСО-А.

В 2013-2015 годах в ходе реформы науки и Российской академии наук и передачи ВНЦ РАН и научных организаций, входящих в его состав, в ведение Федерального агентства научных организаций было принято важное решение – создать на базе ВНЦ РАН Федеральный научный центр «Владикавказский научный центр Российской академии наук» с полным федеральным финансированием, присоединив к нему следующие научные учреждения, подведомственные ФАНО России:
  • Геофизический институт ВНЦ РАН
  • Институт биомедицинских исследований ВНЦ РАН
  • Северо-Кавказский научно-исследовательский институт горного и предгорного сельского хозяйства
  • Северо-Осетинский институт гуманитарных и социальных исследований им. В.И. Абаева
  • Центр скифо-аланских исследований им. В.И. Абаева
  • Южный математический институт ВНЦ РАН.
ВНЦ РАН за годы своего существования создал в республике устойчивую академическую систему организации и проведения научных исследований и подготовки научных кадров высшей квалификации в области математики, наук о Земле (геофизика, геоэкология), фундаментальной медицины (биомедицина), историко-филологических наук, общественных наук, сельскохозяйственных наук (земледелие; растениеводство; механизация, электрификация и автоматизация).